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某大学HPC高性能计算项目

项目背景

        高性能计算( High Performance Computing ),是指用计算机来求解科学研究和工程技术中所遇到的大规模数学计算问题。广泛应用于数学、物理、天文、气象、化学、材料、生物等学科和工程仿真计算领域。

       计算机模拟已逐步成为继实验、理论之后发展起来的能够创造、发现新的科学现象和科学概念的重要方法,以经典力学、统计力学、量子力学和相对论等为理论基础,通过建立适当的数据模型,可用于研究物质或物体在不同尺度下(纳观、微观、介观以及宏观)的振动性质、磁学性质、电学性质、光学性质、力学性质以及热力学性质。

        在生命科学相关领域,计算机计算广泛应用于分子生物学、生物信息学、基因组学、生物医药等多个学科的研究,可从原子、分子、细胞、组织、器官、个体、群体和生态系统等多个尺度系统地解决生命科学中的各种问题,研究不同空间尺度和时间尺度上生命活动与环境的相互关系,从而揭示生命现象的规律和本质。


典型方案

        高性能计算面向的服务对象非常广泛,应用软件众多,归结起来高性能计算的特点是:计算量大、计算时间长、计算任务多、计算文件大;对硬件资源的需求可分为:计算密集、网络密集型、IO密集型和耦合密集型。

         解决方案包含集群门户系统、计算子系统、存储子系统、网络子系统和基础设施子系统,充分满足高性能计算对软硬件的需求。

        计算子系统采用高密度服务器、胖节点和GPU节点;存储系统采用并行存储系统;网络系统中计算网络可采用Mellanox InfiniBand或Intel Onmi-Path 网络,管理网络采用千兆以太网;集群门户系统包含专业的集群管理和作业调度系统。此外,方案还可以集成网络安全设备、相关基础设施,形成完善的整体解决方案。

       为用户提供HPC“一揽子”解决方案方案,按照“交钥匙工程”的标准提供服务。

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